La fiscalización realizada por la Contraloría General de la República a los centros de acopio, almacenamiento, distribución y venta de alimentos de Mercal y de la empresa CASA, determinó que había deficiencias en el manejo del inventario de productos e incluso que no se contaban con los sistemas adecuados para la preservación de alimentos perecederos.

El informe de gestión de 2008 de este organismo señala que los establecimientos inspeccionados, en Mercal y en CASA, presentaron infraestructuras físicas inadecuadas, deficiencias en la cadena de frío (cavas, cuartos de conservación y congelación, neveras y refrigeradores) y en las condiciones de seguridad e higiene.